Bendradarbiaujant mokslui ir pramonei atsirado naujoviškas kovos su pasėlių ligomis metodas, naudojant vietines naudingas dirvožemio bakterijas.
Mokslininkų komanda iš John Innes centro (JK) išskyrė ir ištyrė šimtus Pseudomonas bakterijų padermių iš dirvožemio, surinktų iš ūkių, o paskui nustatė 69 iš jų genomus.
Palyginus tų padermių, kurios slopina patogenų aktyvumą, genomus su tomis, kurios neslopina, komanda sugebėjo nustatyti pagrindinį mechanizmą, apsaugantį bulvių derlių nuo kenksmingų bakterijų.
Tada, pasitelkę chemijos ir genetikos derinį bei daugybę eksperimentų, mokslininkai parodė, kad mažų molekulių, vadinamų cikliniais lipopeptidais, gamyba yra svarbi kovojant su bulvių šašais (bakterinė liga, kuri daro didelę žalą bulvių pasėliui). Šios mažos molekulės turi antibakterinį poveikį patogeninėms šašus sukeliančioms bakterijoms ir padeda naudingosioms Pseudomonas bakterijoms migruoti ir kolonizuoti augalų šaknis.
Eksperimentai taip pat parodė, kad drėkinimas sukelia reikšmingus genetiškai įvairios Pseudomonas populiacijos pokyčius dirvožemyje.
Tyrimas, paskelbtas eLife, siūlo metodą, kuriuo mokslininkai gali ištirti praktiškai bet kurios lauko srities mikrobiomą ir atsižvelgti į skirtingas dirvožemio, agrochemines ir aplinkos sąlygas.
Naudodamiesi didelės spartos genetinės sekos nustatymo pažanga, mokslininkai gali ištirti dirvožemio mikrobiomą, ar nėra naudingų bakterijų, ir nustatyti, kurios molekulės gaminamos, kad slopintų patogenus. Kitas žingsnis – naudingų mikroorganizmų dauginimas ir grąžinimas į tą patį lauką.
Galimas mikrobiomų stiprinimo priemonių panaudojimas apima bakterijų kokteilių naudojimą ant gumbų paviršiaus purškiant arba tiesiai į dirvą naudojant lašelinį drėkinimą.